ありがとうございます。
Windows 10 (実機) で確認しました。問題ありません。websocket を使うためには npm-install.vbs の実行そのものがいらなくなりましたが、npm-update.vbs, npm-install.vbs ともに実行後に変なことは起きていないようです(nakopad.vbs を起動してちょっとプログラムを動かしただけの範囲ですが)。
あと今更 npm-update.vbs の存在に気づきました。npm-update.vbs -> npm-install.vbs だと新しいものが入ったのかなと思いました(未確認)。